توفي ليلة الخميس ١٨/ ١٠/ ١٠٨٧ هـ الثامن عشر من شهر شوال عام سبعة وثمانين وألف من الهجرة، وتولي غسله بيده تلميذه الفاضل أحمد البناء الدمياطي، وصلي عليه بجامع الأزهر يوم الخميس إمامًا بالناس الشيخ شرف الدين بن شيخ الإِسلام زكريا الأنصاري، وكان له مشهد عظيم وحصل للناس عليه من الجزع ما لم يعهد لمثله.